События, о которых рассказывалось в предыдущем фильме, навсегда изменили будущее. Мутанты думали, что предотвратили серьёзную угрозу и теперь могут жить спокойной жизнью. Но как бы не так. Сделать этого им не удастся как минимум по той причине, что люди окончательно возненавидели мутантов и не собираются терпеть их нахождение рядом с собой. Это вынуждает людей с неординарными способностями скрывать свою сущность. Магнито перебрался в тихий городок, в котором смог завести семью и получить работу на заводе. Он был счастлив, но люди отняли у него то, что ему было так дорого. Месть главного героя не заставит себя долго ждать... Тем самым временем тучи над миром сгущаются всё сильнее. Связано это с тем, что древнейший из мутантов пробуждается спустя тысячи лет глубокого сна. И он не намерен делить свой мир с простыми смертными. Он призывает мутантов объединиться против человечества и забрать себе то, что по праву принадлежит им. Сможет ли хоть кто-нибудь остановить этого злоумышленника?