После последних событий главный герой франшизы принимает решение уйти в изгнание. Долгие месяцы он живёт в глухом лесу среди диких зверей, которые ему оказывается роднее и ближе многих представителей человеческого рода. Лишь изредка он появляется в местном поселке, чтобы добыть пропитание. Но долго так продолжаться не могло. Прошлое вновь настигает главного героя. Когда-то давно, ещё во время войны, он спас жизнь одному японскому солдату. С тех пор минуло много лет. И теперь, перед своей смертью, японец решает отыскать Логана и в последний раз отблагодарить его за всё сделанное. Для этого он присылает свою дочь, которая, в конечном счёте, и находит главного героя. Вместе они отправляются в страну восходящего солнца. Логан и представить себе не мог, чем в итоге для него обернется эта, на первый взгляд безобидная поездка. Супергерой в очередной раз сталкивается с серьёзными неприятностями, которые усугубляются потерей способностей к регенерации...
