После того, как силы добра потерпели поражение в соревнование, у сил хаоса появилась возможность ворваться на землю, и они им воспользовались. Император зла по имени Шао Кан, преступил правила турнира с позволения Древнейших Божеств и собирается завладеть землей. Делает он это, путем открытия портала между двумя мирами, задействовав для этого королеву Синдел, мать давным-давно погибшей Китаны, как ключ. У сил зла получилось телепортироваться на планету. Из-за, того, что Шао Кан и королева Синдел стали союзниками, главным героям было нужно только забрать королеву и возвратиться в другой мир.
