В тот момент когда группа военного спецназа пытается сокрушить Бааала, одного из последних правителей гуаулдов, двое его приспешников Тилк и Ваал неожиданно бесследно исчезают. В этой ситуации капитан Картер вместе с помощниками начинает понимать что было нарушенное течение времени, и теперь на Земле программа занимающаяся исследованием Звездных Врат больше не существует. Вернувшиеся назад на Землю военные пытаются доказать ученым и правительству что раньше существовал портал по перемещению в другие звездные, и о том что планете грозит большая опасность и вторжение. А вскоре к Земле прилетает военный флот гуаулдов, во главе с лордом Баалом. И теперь военным нужно вновь отыскать Звездные Врата, чтобы остановить надвигающуюся трагедию.
