В фильме рассказывается про секретную операцию под названием Антропоид, в результате которой должен быть убит генерал СС Рейнхард Гейдрих. Операция Антропоид может нанести значительный удар по нацистской Германии, так как будет уничтожен третий после Гитлера и Гиммлера главнокомандующий. Для этого в конце 1941 года в оккупированную Прагу отправляют специально подготовленных агентов.