История начинается с возникновения дружбы между псом и парнем Шэгги. В ону из ночей Скуби-ду случайно проникает в дом Шэгги Роджерса, они сразу же находят общий язык и заводят настоящую дружбу. Наутро Шэгги приглашает своих друзей познакомиться с Скуби-Ду. Они объединяются в одну команду, под названием «Тайна корпораций». Теперь они проявляют свой интерес исключительно к приведениям и призракам, погружаясь расследованием событий в их колледже, потому что учебное заведение кишит призраками. Когда команду исключают из школы, они принимаются за расследование.
