Бегущий в лабиринте повествует о подростке по имени Томас, который однажды попадает в странный лабиринт. Из прошлой жизни он ничего не помнит. В этом месте есть еще 60 подростков кроме Томаса. И каждый месяц прибывают новые подростки. Ребята выживают в лабиринте как могут. Питаются тем, что сами вырастили и ищут выход из лабиринта. Однажды в лабиринте появляется девочка в состоянии комы. В руках у нее записка со странными иероглифами. Кто она? Что означают иероглифы в записке? Поможет ли подросткам разгадывание тайны записки выбраться из лабиринта? Удастся ли им разгадать эти тайны и вернуться к нормальной жизни?