В канализационной трубе города Нью-Йорк неизвестным образом очутились радиационные отходы. По всей видимости, все это дело рук людей, которые с неосторожностью относятся к своей работе. В вещество попали четыре черепашки и одна крыса. Вскоре животные приобрели человеческий рост. Кроме того, они начали говорить. Криса по имени Сплинтер обучила своих подопечным боевым искусствам. Спустя какое-то время Леонардо, Донателло, Рафаэль и Микеланджело будут сражаться за покой своего города. Помимо этого, у них появится подружка Эйприл. Девушка работает журналистом. Друзья столкнутся с проблемами, которые угрожают всему городу Нью-Йорк.
