Джеймс Кирк, капитан корабля «Энтерпрайз», вернулся со своей командой из очередной миссии на Землю. Но, вернувшись, команда увидела, что за время их отсутствия многое изменилось. Некий противник смог подорвать основные устои Федерации, проникнув внутрь правительственной системы. И пока люди находятся в ужасе и отчаянии, а армия бездействует, враги все больше и больше опутывают своими сетями, угрожая всему живому, и самой планете. Кирку и его команде предстоит сражаться в одиночку с опасными и хитрыми противниками, на свой страх и риск.